Onimusha 3 é o terceiro game da franquia de enorme sucesso em todo o mundo, Onimusha. O enredo do jogo gira em torno do espadachim Samanosuke Akechi, que está novamente em uma missão para derrotar seu inimigo, Nobunaga Oda, que deseja conquistar o Japão com seu exército de demônios conhecido como Genma, e para isso, nosso protagonista muda de lugar com um oficial francês do futuro chamado Jacques Blanc.
O game conta com elementos de jogos anteriores da franquia, incluindo o uso de várias armas especiais, com o intuito de combater os inimigos e absorver sua energia para melhorar suas habilidades. Desta vez, você irá controlar principalmente Samanosuke e Jacques, e ambos são capazes de trocar itens para resolver os desafiadores puzzles do jogo.
A trama de Onimusha 3 tem início em um momento decisivo no ano de 1582. Depois de um período desaparecido, decorrente dos acontecimentos do primeiro jogo, o nobre Samanosuke Akechi retorna não só como protagonista, mas também para comandar uma investida final no Castelo Honnoji. O herói ficou ausente durante um período para aperfeiçoar suas habilidades, principalmente o controle dos poderes provenientes da Manopla Oni, que lhe permitiu se transformar no lendário guerreiro Onimusha.
Na abertura do jogo é possível ver que Samanosuke está em uma missão importante para evitar que uma massiva tropa de guerreiros Genma chegue para dar assistência a seu mestre sombrio, Nobunaga Oda. A investida do clã Akechi em Honnoji culmina em um embate final entre o samurai e seu nêmesis, mas algo improvável acontece, podendo mudar para sempre o rumo desta história. Prestes a receber um ataque mortal de Nobunaga, Samanosuke é sugado por um portal temporal que o leva para outro lugar, em outra época.
Em 2004, na cidade de Paris, tropas Genma misteriosamente invadem e massacram a população local. Dando assistência no que é possível, um implacável policial chamado Jacques Blanc, interpretado pelo ator francês Jean Reno, luta com todas as forças para defender os cidadãos. Neste momento, Samanosuke surge na Paris de 2004, perdido e sem saber o que está acontecendo. Os dois heróis têm um breve encontro até que o samurai, ao ver a ameaça dos Genma contra os franceses, parte para o ataque enquanto um segundo portal se abre levando Jacques para o Japão do século XVI, 10 dias antes do ataque a Honnoji.
Samanosuke e Jacques lutam de forma parecida, apesar de algumas peculiaridades. O francês tem a vantagem de poder se locomover verticalmente em pontos específicos graças ao uso de seu chicote e armas que lhe dão uma vantagem no quesito de alcance, como lanças e maças. Já o samurai dispõe de um arsenal de armas mais poderosas, como espadas e flechas imbuídas de poder elemental.
Em determinados momentos estamos jogando com os dois heróis no mesmo local, cada um em sua época, e é a Tengu quem oferece uma assistência extra quando algo que Jacques realiza no passado influencia no futuro para Samanosuke, e vice-versa em alguns momentos. Além de permitir o transporte de itens importantes ou comuns, como cura ou recuperação de magia, de um para o outro.
Após uma intensa campanha recheada de inúmeros inimigos, desafios de habilidade, quebra-cabeças, chefes e uma história com vários momentos emocionantes, Samanosuke e Jacques conseguem voltar para suas respectivas épocas e colocar o tempo em ordem. O francês consegue ajudar o Samanosuke do passado a chegar até Honnoji enquanto, no presente, o implacável samurai consegue acabar com os planos dos Genma de dominar o mundo naquela e em outras épocas da história.
